近日，一组意大利学者撰文，阐述研究显示，新型冠状病毒有可能在2019年10月至11月就已经开始传播。这篇意大利米兰国立大学的论文于2020年2月25日在线发表于《医学病毒学杂志》（Journal of Medical Virology），题目为《SARS‐CoV‐2有效繁殖数量的早期系统发育评估》（Early phylogenetic estimate of the effective reproduction number of SARS‐CoV‐2）。

《医学病毒学杂志》4月号封面（来源：Wiley Online Library）

以下是绿会国际部同事整理为中文的该论文摘要，（限于水平，可能存在与原文不尽吻合之处），供读者参考。

【摘要】

为了重建最近在中国武汉爆发的新型冠状病毒的进化动态，全球共享所有流感数据倡议组织于2020年2月4日提供的52个SARS‐CoV‐2基因组被进行了分析。用于估计繁殖数量的两个模型(基于合并的指数增长和出生-死亡天际线法)表明，估计的平均进化率为7.8×10−4个子/位点/年(范围1.1×10−4‐15×10−4)和树根的平均tMRCA为73天。估计的R值为2.6 (范围为2.1‐5.1)，并且在2019年12月从0.8上升至2.4。该流行病的估计平均倍增时间在3.6天到4.1天之间。这项研究证明了即使在流行病流行的情况下，系统发育学也有助于监测新出现的新感染。

（来源：Wiley Online Library）

该论文强调：

本研究的目的是研究SARS‐CoV‐2的时间起源、病毒进化速率和种群动态。

所使用的贝叶斯方法指出了2019年10月至11月间该流行病最可能的起源。

到2019年12月，当平均翻倍时间为4天左右时，预计有效繁殖数从0.8增加到2.4。

本研究证明了系统发育在监测新发感染中的作用。

同时，围绕该论文得出的结论，绿会还了解到以下信息：

模型结论：新型冠状病毒早在2019年10-11月就已经开始传播。

本研究中获得的SARS-CoV-2系统发育的时间重建与先前的估计相符，表明该流行病起源于2019年10月至2019年11月之间，即描述第一例病例（武汉能查证到的12月1日最早病例）数周之前。这通过合并分析和估计流行病起源的出生死亡方法得到了证实。

（来源：Wiley Online Library）

意大利学者认为新型冠状病毒在去年12月中旬就已经在意大利爆发，之前检出的38岁的意大利科多尼奥男子并非该国第一个病患，否则解释不了意大利在短时间内突然检查出来几百例被传染者。

另据报道，去年圣诞节期间意大利皮亚琴察市医院已经住满了40多例异常肺炎患者。

【参考链接：】

《医学病毒学杂志》在线论文原文《SARS‐CoV‐2有效繁殖数量的早期系统发育评估》

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/jmv.25723

《SARS‐CoV‐2有效繁殖数量的早期系统发育评估》PDF版本：

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1002/jmv.25723